محققان مؤسسه تحقیقات پزشکی برنهام (Burnham) درصد زیادی از کل مکمل پروتئین (پروتئوم) را در مخمر شکافت Schizosaccharomyces pombe (S. pombe) رمزگشایی کردند.
لارنس بریل، خاطره معتمدچابوکی، دکتری. و محقق ارشد دیتر وولف، دکترا، روش جدیدی را توسعه دادند که برای شناسایی 4600 پروتئین در ارگانیسم با استفاده از مجموعه ای از تکنیک های پیچیده استفاده می شود. این تحقیق در 9 مارس به صورت آنلاین در مجله Methods منتشر شد.
دکتر می‌گوید: «تجزیه و تحلیل پروتئوم یک ارگانیسم چیزهای بیشتری از تجزیه و تحلیل ساده توالی DNA به ما می‌گوید.»گرگ تجزیه و تحلیل پروتئوم به ما تصویری فوری از پروتئین هایی که در هر نقطه از زمان در سلول بیان می شوند به ما می دهد. این می تواند به ما بگوید که چگونه بیان پروتئین در پاسخ به محرک های خاص و در حالات بیماری تغییر می کند، که ممکن است به شناسایی نشانگرهای زیستی جدید برای بیماری ها کمک کند. ما اکنون با همکاری مدیر برنامه سلول‌های بنیادی برنهام، ایوان اسنایدر، این روش را برای پروفایل پروتئینی سلول‌های بنیادی انسانی به کار می‌بریم.»
روش توسعه یافته توسط دانشمندان برنهام شامل هضم پروتئین ها به پپتیدهای کوچکتر و سپس جداسازی پپتیدها بر اساس بار الکترواستاتیک با استفاده از کروماتوگرافی تبادل آنیونی قوی بود. پپتیدها بیشتر با وزن مولکولی با استفاده از کروماتوگرافی مایع فشار بالا جدا شدند. هر یک از پپتیدهای فردی با استفاده از طیف سنجی جرمی و تجزیه و تحلیل پایگاه داده شناسایی و شناسایی شدند. تجزیه و تحلیل DNA ژنوم مخمر 5027 پروتئین را پیش بینی می کند. این تیم 4600 پروتئین را شناسایی کردند که کاملاً کل پروتئوم نیست.400 باقیمانده فقط در حالت جفت گیری S. pombe بیان می شود.
S. پومبه اغلب به عنوان یک ارگانیسم مدل برای مطالعه پاسخ آسیب DNA و ترمیم، تقسیم سلولی، پاسخ های استرس و دیگر جنبه های زیست شناسی سلولی استفاده می شود.
